Fundus muzeja broji preko 100 000 predmeta kulturno-povijesnoga, političkoga, vojnog i etnografskoga karaktera, raspoređenih u 18 zbirki. 

Zbirka ordena, medalja, plaketa, diploma, pečata i grbova

Zbirka oružja i vojne opreme

Zbirka plakata i promidžbenog materijala

Zbirka starih razglednica

Zbirka pomorstva i brodogradnje

Zbirka subgradskog života

Zbirka tiska

Zbirka zastava

Zbirka značajnih ličnosti

Grafička zbirka

Kartografska zbirka

Numizmatička zbirka

Zbirka fotografija, negativa i fotografske opreme

Zbirka gradskog života